内蒙古自治区教育科学研究所是内蒙古自治区教育厅直属事业单位。

承担对自治区教育改革和发展重大问题研究咨询和决策服务；普及教育科研知识，组织、协调、统筹、指导全区教育科研工作；组织全区性教育学术活动和教育信息交流活动；推广教育教学改革成果，评审、鉴定教育科研成果；承担教育行政人员与教师现代教育思想和现代教育管理的培训；承担自治区教育科学规划课题立项、指导、过程与结题管理工作；承担《内蒙古教育》（蒙文版）刊物的编辑、出版与发行任务。